More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1202 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1202  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  301  3.0000000000000004e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.718344  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1209  AsnC family transcriptional regulator  69.74 
 
 
152 aa  224  5.0000000000000005e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2860  transcriptional regulator, AsnC family  57.43 
 
 
155 aa  184  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.41994  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  26.71 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  28.03 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1178  regulatory protein AsnC/Lrp family  29.53 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  36.56 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  24 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  36.56 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  36.56 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  26.19 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1418  AsnC family transcriptional regulator  24.82 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  36.56 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  22.45 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  26.28 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  25.34 
 
 
172 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  28.48 
 
 
152 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  25.33 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
167 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0717  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  25.33 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  52.38 
 
 
167 aa  60.8  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  25.33 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  27.81 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  27.08 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
173 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  24.65 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  33.7 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  23.33 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0828  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  27.55 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  33.7 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  26.49 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  29.59 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  29.59 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  27.14 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  27.59 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  27.59 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  24.8 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0732  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 
166 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  28.17 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2297  transcriptional regulator, AsnC family  24.66 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0299  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.17 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3217  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4306  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  31.78 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  25.83 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4066  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  25.55 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4300  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  22.97 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  24.65 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  26.21 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4195  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.136531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>