More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2096 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  79.22 
 
 
157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  50.33 
 
 
157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 
157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 
156 aa  149  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  48.37 
 
 
155 aa  137  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  44.23 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 
167 aa  124  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 
157 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
158 aa  121  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
167 aa  120  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.88 
 
 
159 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 
168 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
170 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
161 aa  100  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 
152 aa  97.1  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 
169 aa  94.4  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  35.97 
 
 
173 aa  84  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
155 aa  83.6  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.68 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.46 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  31.03 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.61 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  33.97 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  31.43 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  27.81 
 
 
172 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0682  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.99 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  28.76 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.4 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  31.78 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.4 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.4 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1202  AsnC family transcriptional regulator  28.03 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.718344  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.4 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.33 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.4 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.95 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.93 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.08 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.29 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.68 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.68 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.68 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  28.29 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.29 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.29 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.29 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  28.29 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>