More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10540 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 165 aa  326  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  58.39 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 155 aa  167  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  56.29 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 178 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  52.29 
 
 		 160 aa  160  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  53.55 
 
 		 169 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  56 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  52.35 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 156 aa  140  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  54.81 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  54.81 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.95 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  46.85 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.57 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 160 aa  103  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  43.62 
 
 		 172 aa  103  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 169 aa  97.4  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  40.6 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  29.87 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  27.52 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  26.95 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  29.86 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  31.5 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0828  AsnC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.73 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  31.3 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  28.28 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  28.24 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.9 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  26.53 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  35.29 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  23.74 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.09 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.09 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.09 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  26.53 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0849  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  26.53 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  26.53 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>