More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8338 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
155 aa  303  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  80.67 
 
 
158 aa  243  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  48.63 
 
 
169 aa  151  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  50.99 
 
 
160 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 
154 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 
155 aa  148  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  48.37 
 
 
178 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  48.34 
 
 
188 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.35 
 
 
159 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.21 
 
 
157 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 
158 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  47.37 
 
 
156 aa  140  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  51.88 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  49.25 
 
 
173 aa  128  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 
158 aa  127  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
157 aa  123  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 
157 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  45.95 
 
 
165 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 
159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
170 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  38.31 
 
 
161 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 
167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
167 aa  110  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
169 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  36.91 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 
152 aa  103  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  42.42 
 
 
157 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 
168 aa  93.6  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.19 
 
 
153 aa  87  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.51 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.51 
 
 
153 aa  85.1  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.51 
 
 
164 aa  84.3  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.51 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
164 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
164 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
164 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
153 aa  84  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.85 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.85 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.85 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.65 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.65 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.65 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.65 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.65 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  32.65 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  32.81 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.65 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.65 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.85 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0849  AsnC family transcriptional regulator  32.91 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.12 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.61 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.97 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  31.93 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.12 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  29.05 
 
 
157 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  27.03 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.43 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  30.88 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>