More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0527 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
156 aa  297  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  59.62 
 
 
158 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  59.21 
 
 
160 aa  177  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  60.53 
 
 
154 aa  176  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  58.67 
 
 
188 aa  172  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  56.77 
 
 
155 aa  170  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  59.48 
 
 
159 aa  170  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  55.92 
 
 
169 aa  167  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  56 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  52.35 
 
 
165 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  56.93 
 
 
173 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
156 aa  141  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  55.47 
 
 
155 aa  140  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.37 
 
 
155 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 
160 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.98 
 
 
157 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.77 
 
 
159 aa  120  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 
158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  46.71 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  44.85 
 
 
167 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  43.8 
 
 
167 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  43.87 
 
 
172 aa  110  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
170 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 
157 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  38.56 
 
 
161 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
157 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
169 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  31.91 
 
 
156 aa  89  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  41.82 
 
 
170 aa  87.8  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  29.17 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  38.35 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 
155 aa  79  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.77 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.4 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.4 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.4 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.4 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  34.75 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 
174 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  25.87 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  26.49 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  25.87 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.4 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.86 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.86 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  25.66 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  25.87 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.86 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.86 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.37 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  30.72 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  29.22 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.76 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>