More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1294 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
155 aa  303  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  67.32 
 
 
188 aa  201  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 
178 aa  200  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  68.67 
 
 
159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  65.13 
 
 
158 aa  198  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  66.45 
 
 
154 aa  197  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  64 
 
 
160 aa  190  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  64.67 
 
 
169 aa  188  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  56.77 
 
 
156 aa  170  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  58.55 
 
 
165 aa  167  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  55.63 
 
 
157 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 
156 aa  154  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  60.74 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  60.58 
 
 
173 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  52 
 
 
155 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.1 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 
172 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  47.26 
 
 
167 aa  117  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  45.89 
 
 
167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  41.94 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 
159 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
170 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 
160 aa  103  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 
155 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
168 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 
157 aa  100  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
157 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 
157 aa  99  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  41.5 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
169 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  37.23 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  37.59 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.94 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.94 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.94 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.94 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  29.22 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.94 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.33 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.53 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.22 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.22 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.22 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  25.17 
 
 
157 aa  77  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.22 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.22 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.22 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  31.94 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.22 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.68 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.41 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.5 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  27.78 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.78 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.5 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.85 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.85 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  31.37 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.85 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.77 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.77 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.77 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.77 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  32.03 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.77 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  30.77 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.77 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.56 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.56 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  32.03 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.21 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.21 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>