More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2562 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  315  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  53.55 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  48.7 
 
 
160 aa  156  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 
155 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 
154 aa  151  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  49.33 
 
 
159 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  46.41 
 
 
188 aa  144  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  47.37 
 
 
169 aa  141  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  48.65 
 
 
165 aa  140  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  45.16 
 
 
156 aa  141  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
178 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  47.89 
 
 
155 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  48.18 
 
 
173 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 
157 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 
159 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 
160 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 
167 aa  98.2  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  38.56 
 
 
172 aa  97.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
167 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  29.53 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  34.07 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  28.17 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  26.89 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  26.05 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  26.97 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  28.76 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  30.52 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  25.71 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  31.93 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  31.93 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  31.93 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  21.29 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  26.57 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  25 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  24.48 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  24.16 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  25.33 
 
 
168 aa  63.5  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 
167 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  29.51 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  24.48 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  24.48 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  23.49 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  23.78 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  29.31 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  30.07 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
170 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  23.68 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  26.97 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  23.4 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  28.26 
 
 
156 aa  61.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
140 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  29.61 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>