More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3209 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
149 aa  298  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  88.28 
 
 
152 aa  258  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  65.31 
 
 
164 aa  204  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  68.06 
 
 
153 aa  201  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  65.28 
 
 
169 aa  195  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  61.9 
 
 
151 aa  194  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  60.96 
 
 
159 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  63.95 
 
 
148 aa  178  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  63.95 
 
 
150 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  59.72 
 
 
152 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  59.72 
 
 
152 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  59.86 
 
 
152 aa  167  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  56.38 
 
 
154 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  57.64 
 
 
153 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  57.64 
 
 
153 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  58.45 
 
 
193 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  58.45 
 
 
193 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  55.7 
 
 
154 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  58.45 
 
 
295 aa  158  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  55.7 
 
 
154 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  55.7 
 
 
154 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  55.7 
 
 
154 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  55.7 
 
 
154 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  55.7 
 
 
154 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 
153 aa  154  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 
153 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 
153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 
153 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 
153 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  53.9 
 
 
153 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  52.48 
 
 
146 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  45.77 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 
142 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  45.07 
 
 
143 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  44.6 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 
142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 
143 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  43.88 
 
 
149 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 
142 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
152 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 
143 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 
143 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 
143 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.3 
 
 
142 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
156 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 
143 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 
143 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 
147 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  38.85 
 
 
145 aa  97.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
140 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  41.01 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 
140 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
141 aa  90.5  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  34.75 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  34.75 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
141 aa  87.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  38.24 
 
 
141 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  38.97 
 
 
141 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.97 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
175 aa  84.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 
145 aa  84  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 
156 aa  84  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  35.56 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  32.35 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
162 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 
166 aa  77  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  34.04 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>