More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1026 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
158 aa  310  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  80.67 
 
 
155 aa  243  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  48.37 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  51.97 
 
 
160 aa  147  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  51.3 
 
 
154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.95 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  51.32 
 
 
188 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  50.98 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 
178 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.35 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 
156 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 
172 aa  131  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  51.52 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  48.32 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  49.62 
 
 
173 aa  127  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.6 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.54 
 
 
158 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  43.54 
 
 
161 aa  124  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
156 aa  123  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
170 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 
160 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 
157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  43.54 
 
 
157 aa  117  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
167 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 
169 aa  104  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  43.18 
 
 
157 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 
152 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 
168 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 
156 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
168 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 
157 aa  97.4  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
153 aa  95.5  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
153 aa  93.6  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.88 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
157 aa  92  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.88 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
153 aa  91.3  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.88 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.19 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
149 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.19 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.19 
 
 
164 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.19 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.19 
 
 
164 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.19 
 
 
164 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  29.45 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  28.08 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  28.67 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.25 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.1 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.79 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.1 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  30.83 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.57 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 
175 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
174 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.89 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.89 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.89 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.21 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.7 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>