More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3744 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 159 aa  304  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  68.28 
 
 		 160 aa  201  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  58.22 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 167 aa  170  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.39 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  49.64 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  48.98 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  44.67 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  45.77 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  41.38 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  41.78 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  43.45 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  44.2 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  42.45 
 
 		 169 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.29 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 178 aa  97.4  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.84 
 
 		 188 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 161 aa  94.7  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  32.61 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  34.56 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  36.29 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  34.19 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.09 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.58 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.58 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.58 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.58 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.58 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.09 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.58 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.58 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  27.61 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.84 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  31.5 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  35.97 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  34.33 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.84 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  30.2 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.84 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.84 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.09 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  30.83 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.84 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  32.84 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  30.2 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>