More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3986 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  93.33 
 
 
152 aa  279  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.71 
 
 
168 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  47.62 
 
 
155 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 
160 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 
159 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  44.9 
 
 
167 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 
156 aa  120  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 
157 aa  111  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.27 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 
158 aa  104  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
154 aa  101  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  40.37 
 
 
170 aa  100  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.27 
 
 
188 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
160 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  42.54 
 
 
155 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 
169 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
165 aa  97.4  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
156 aa  95.9  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
155 aa  94.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 
159 aa  94.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  41.04 
 
 
173 aa  92.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
157 aa  91.3  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 
157 aa  87.8  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
140 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 
172 aa  84.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  29.79 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 
149 aa  80.5  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>