More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4859 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 155 aa  297  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  57.24 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 157 aa  158  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  51.61 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.63 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  48.68 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  48.68 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  48.37 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  55.22 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  47.74 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  46.71 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.38 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 		 169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 		 161 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  44.12 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.41 
 
 		 188 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  39.24 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 178 aa  97.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 		 173 aa  94.4  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 150 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  34.64 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  34.81 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0849  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  35.11 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  34.64 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  33.99 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0682  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  30.92 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  26.42 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  26.03 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  32.67 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>