More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2657 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  280  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  41.84 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 193 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 193 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 169 aa  103  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 159 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 295 aa  103  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  37.59 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  37.86 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  35.46 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  37.23 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  38.52 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  39.71 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 154 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 149 aa  97.4  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 154 aa  97.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  40.94 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 148 aa  94.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.68 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.23 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 146 aa  91.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 145 aa  91.3  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 145 aa  90.5  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 175 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  34.56 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  35.88 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.34 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3964  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>