More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4819 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  306  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  88.24 
 
 		 153 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  88.24 
 
 		 153 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  87.58 
 
 		 153 aa  268  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  84.97 
 
 		 153 aa  261  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  84.97 
 
 		 153 aa  258  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  85.52 
 
 		 146 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 153 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 153 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 152 aa  197  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 152 aa  198  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  64.67 
 
 		 152 aa  197  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 193 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 193 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 295 aa  196  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 154 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 154 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 154 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 154 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 154 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 154 aa  191  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 169 aa  165  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 152 aa  156  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  52.48 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 149 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  55.91 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 154 aa  136  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  48.2 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 142 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 149 aa  115  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.69 
 
 		 142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  43.07 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  41.3 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  40.88 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.41 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  28.86 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  32.12 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>