More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2036 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
150 aa  293  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  99.32 
 
 
148 aa  287  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  80.67 
 
 
169 aa  241  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  71.33 
 
 
151 aa  216  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 
159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  68.71 
 
 
153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  63.95 
 
 
149 aa  193  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  65.03 
 
 
152 aa  193  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  63.33 
 
 
164 aa  185  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  57.04 
 
 
152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 
152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 
152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  55.78 
 
 
154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 
153 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  55.24 
 
 
153 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 
153 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 
153 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  55.1 
 
 
154 aa  158  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  55.1 
 
 
154 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  55.1 
 
 
154 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  55.1 
 
 
154 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  55.1 
 
 
154 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  55.32 
 
 
153 aa  158  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  55.1 
 
 
154 aa  156  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  55.32 
 
 
146 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  54.17 
 
 
153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  54.11 
 
 
153 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  54.11 
 
 
153 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  54.79 
 
 
295 aa  152  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  54.11 
 
 
193 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  54.11 
 
 
193 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  48.91 
 
 
154 aa  130  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  50.36 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  47.52 
 
 
143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  47.45 
 
 
149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  46.72 
 
 
149 aa  124  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  45.99 
 
 
142 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  45.99 
 
 
143 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
143 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
143 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
143 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
143 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
142 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
140 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 
156 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 
142 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.96 
 
 
142 aa  103  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 
148 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
146 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  39.26 
 
 
140 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
141 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  37.96 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
143 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 
156 aa  90.1  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
154 aa  89.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
147 aa  88.6  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  37.5 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
140 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
140 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
161 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
141 aa  87  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  31.91 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 
145 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  31.91 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
170 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
143 aa  84  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
153 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  33.09 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>