More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4836 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  283  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  96.55 
 
 		 145 aa  274  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  94.48 
 
 		 145 aa  270  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5478  AsnC family transcriptional regulator  83.57 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412083  normal  0.963239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 145 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 145 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  46.21 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 295 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2577  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  31.34 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  30.28 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  35.71 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2602  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0876876  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2062  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.78 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  30 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>