More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2602 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2602  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  275  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0876876  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  82.88 
 
 		 146 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  82.88 
 
 		 146 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  82.19 
 
 		 162 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  74.66 
 
 		 194 aa  217  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  75.34 
 
 		 146 aa  216  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  75 
 
 		 146 aa  211  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2577  AsnC family transcriptional regulator  61.97 
 
 		 165 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  28.99 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  37.76 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  32.61 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  27.78 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  40.35 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.26 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 193 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 193 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  25.37 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0500  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  31.65 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  27.08 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03072  leucine responsive regulatory protein  36.61 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>