More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000552 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  317  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  72.85 
 
 		 151 aa  246  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 143 aa  116  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  40.94 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  39.04 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  33.91 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  31.3 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  31.3 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  31.3 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  31.3 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  31.3 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  31.3 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  31.3 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  31.3 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  33.07 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  33.07 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1159  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  33.91 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0927  leucine-responsive regulatory DNA-binding transcription regulator protein  29.57 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  32.43 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  29.37 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  30.57 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.87 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  34.11 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  29.37 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  30.67 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  30.67 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  30.67 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  30.67 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  30.67 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  27.89 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  36.7 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.37 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  28.7 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  28.35 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  30.67 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  29.37 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  29.37 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  27.83 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>