More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3598 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  87.32 
 
 		 143 aa  262  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  87.32 
 
 		 143 aa  262  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  87.32 
 
 		 143 aa  261  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  87.32 
 
 		 143 aa  261  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  87.32 
 
 		 143 aa  261  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  87.32 
 
 		 143 aa  261  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  87.32 
 
 		 143 aa  261  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  86.62 
 
 		 158 aa  261  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  87.32 
 
 		 145 aa  260  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  85.21 
 
 		 143 aa  255  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  83.57 
 
 		 143 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  80.99 
 
 		 157 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  39.04 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  38.26 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0245  AsnC family transcriptional regulator  82.22 
 
 		 45 aa  83.6  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  32.64 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.17 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.17 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 		 157 aa  72  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  32.74 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  33.63 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  33.63 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3196  transcriptional regulator, AsnC family  32.74 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  36.75 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  32.74 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  31.67 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>