More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3959 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  329  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  99.3 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  99.3 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  97.9 
 
 		 143 aa  290  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  96.5 
 
 		 143 aa  287  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  96.5 
 
 		 143 aa  287  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  96.5 
 
 		 143 aa  287  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  96.5 
 
 		 143 aa  287  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  90 
 
 		 143 aa  269  9e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  88.11 
 
 		 143 aa  264  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  86.62 
 
 		 142 aa  261  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  83.92 
 
 		 145 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  81.43 
 
 		 157 aa  244  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  41.1 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  40.27 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 150 aa  90.5  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 157 aa  87.4  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  34.23 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  33.61 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0245  AsnC family transcriptional regulator  75.56 
 
 		 45 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.8 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  39.81 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  30.34 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1435  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.855042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  29.53 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 218 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  36.21 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.79 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  34.78 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  35.65 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  33.9 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2602  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0876876  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  35.65 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  27.78 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>