More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2396 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  99.32 
 
 		 162 aa  275  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2602  AsnC family transcriptional regulator  82.88 
 
 		 146 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0876876  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  73.29 
 
 		 194 aa  214  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  73.97 
 
 		 146 aa  214  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  75 
 
 		 146 aa  213  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2577  AsnC family transcriptional regulator  65.49 
 
 		 165 aa  166  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 169 aa  84.3  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 157 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  28.57 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  32.62 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  28.28 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  31.88 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  37.25 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  26.87 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 153 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 146 aa  67  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 140 aa  67  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1159  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  26.12 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 295 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  35.66 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  25.53 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5801  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.423698  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6165  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>