More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2801 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  100 
 
 		 141 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  99.29 
 
 		 141 aa  270  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  90.71 
 
 		 141 aa  244  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 153 aa  140  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 143 aa  133  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  53.68 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  51.08 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  49.65 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  49.26 
 
 		 148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  53.24 
 
 		 143 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 143 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 140 aa  120  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3964  AsnC family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  45.19 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  38.06 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  40.29 
 
 		 153 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  38.24 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  38.85 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  36.3 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 154 aa  86.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  38.97 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 194 aa  73.9  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2577  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.78 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.51 
 
 		 188 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  39.23 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>