More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0697 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  291  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  291  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  57.45 
 
 		 146 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 157 aa  166  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 145 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5478  AsnC family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 190 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412083  normal  0.963239 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 150 aa  94.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 193 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 193 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 295 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 152 aa  86.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  35.25 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  32.61 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.43 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  37.6 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2602  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0876876  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  32.14 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>