More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1937 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  283  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  51.75 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  51.75 
 
 		 153 aa  136  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 154 aa  136  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.07 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 193 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 193 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 295 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 142 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 154 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  43.97 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  43.26 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  46.85 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 142 aa  105  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 150 aa  104  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  36.88 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  34.56 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  37.96 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  37.23 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2577  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  28.15 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.78 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>