More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3562 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  313  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  60.42 
 
 		 146 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 145 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5478  AsnC family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 190 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412083  normal  0.963239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  38.19 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  38.78 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  38.78 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  38.78 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  34.93 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  38.51 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  38.51 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  38.51 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  38.51 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  38.51 
 
 		 164 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 143 aa  87  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  37.84 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  37.84 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  37.16 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  37.16 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  36.81 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  36.81 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  33.8 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  36.81 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  33.99 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  33.8 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  33.8 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  33.8 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.17 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  33.8 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  33.8 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>