More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5478 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5478  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412083  normal  0.963239 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  85 
 
 		 145 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  83.57 
 
 		 145 aa  221  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  90.98 
 
 		 145 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 146 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 143 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  29.37 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 146 aa  62  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 143 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 143 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 158 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 143 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  33.87 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  37.9 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.89 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  30.83 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  36.21 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  34.15 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  28.37 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  27.21 
 
 		 149 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  30.91 
 
 		 152 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  29.27 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  31.82 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 143 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>