More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05336 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  100 
 
 		 151 aa  317  5e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  72.85 
 
 		 151 aa  246  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  41.78 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  41.1 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  36.59 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  34.04 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  30.08 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  30.08 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  30.08 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  30.08 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  30.14 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  30.89 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  30.08 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  30.08 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  30.08 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  30.08 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  29.17 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  32.52 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1159  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  30.46 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 182 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0927  leucine-responsive regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.08 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  26.06 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  26.06 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  26.06 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2602  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0876876  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  29.37 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  25.35 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  26.06 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0500  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  30.87 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  30.19 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  30.19 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03072  leucine responsive regulatory protein  31.69 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  29.56 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2577  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>