More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0243 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  297  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  87.32 
 
 		 142 aa  260  4.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 143 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 143 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 143 aa  251  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 143 aa  251  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  84.62 
 
 		 143 aa  251  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 143 aa  251  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  83.92 
 
 		 158 aa  251  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 143 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  83.22 
 
 		 143 aa  248  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  81.69 
 
 		 157 aa  245  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  83.57 
 
 		 143 aa  244  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  38.36 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  38.26 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0245  AsnC family transcriptional regulator  86.67 
 
 		 45 aa  86.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  34.03 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.29 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  27.14 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  26.43 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  37.4 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 295 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  66.6  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  36.43 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  36.43 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>