More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00400 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  52.35 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  54.48 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  48.68 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4434  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3765  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 169 aa  120  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.18 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.91 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1294  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.262415  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 		 160 aa  97.1  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0706  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 		 173 aa  90.9  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4249  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.77 
 
 		 188 aa  87.4  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.195159  normal  0.0388839 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4679  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 178 aa  84  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437677  normal  0.113491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.41 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2562  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147612  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  29.08 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3088  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1925  transcriptional regulator, AsnC family  28.95 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  33.33 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  34.72 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  29.87 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  32.86 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>