More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2273 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  98.69 
 
 
295 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
153 aa  298  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
153 aa  298  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
193 aa  298  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
193 aa  298  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  92.16 
 
 
154 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  92.81 
 
 
154 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  92.16 
 
 
154 aa  279  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  92.16 
 
 
154 aa  279  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  92.16 
 
 
154 aa  279  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  92.16 
 
 
154 aa  279  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  91.5 
 
 
154 aa  275  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  89.33 
 
 
152 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  87.5 
 
 
152 aa  265  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  87.5 
 
 
152 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  68.31 
 
 
153 aa  200  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 
153 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 
153 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  63.33 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  63.33 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  65.1 
 
 
153 aa  194  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  64.79 
 
 
146 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  56.34 
 
 
153 aa  163  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  57.34 
 
 
152 aa  160  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  57.64 
 
 
149 aa  160  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 
164 aa  157  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 
151 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  54.17 
 
 
159 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 
169 aa  150  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  53.79 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  53.79 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  50.7 
 
 
153 aa  124  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 
154 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  48.18 
 
 
142 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  49.64 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  48.18 
 
 
149 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  48.18 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  47.45 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  43.07 
 
 
142 aa  114  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.07 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
148 aa  110  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  49.29 
 
 
152 aa  110  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 
143 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
143 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
143 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
143 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 
142 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  41.01 
 
 
145 aa  97.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  40.44 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  34.46 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 
147 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  38.97 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  33.11 
 
 
150 aa  90.1  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  41.01 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
154 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 
140 aa  87  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
141 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.5 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  33.82 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  30.28 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  36.03 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>