More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3545 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  323  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 143 aa  147  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  51.09 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 143 aa  143  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 145 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  45.65 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  40.43 
 
 		 151 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  36.3 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 150 aa  97.1  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  38.68 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 194 aa  84.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 146 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  31.62 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  30.6 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2577  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6805  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.6 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  35.96 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 182 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 182 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2602  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0876876  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 182 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 182 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  34.72 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  34.72 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  34.72 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  28.36 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  34.72 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.71 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.43 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  34.72 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  34.72 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  34.72 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  34.72 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.69 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>