More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0316 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  295  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  90.91 
 
 		 143 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  90.91 
 
 		 143 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  90.91 
 
 		 143 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  90.91 
 
 		 143 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  89.51 
 
 		 143 aa  268  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  88.81 
 
 		 143 aa  265  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  88.81 
 
 		 143 aa  265  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  88.11 
 
 		 158 aa  264  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  85.21 
 
 		 142 aa  255  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  83.8 
 
 		 143 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  83.22 
 
 		 145 aa  248  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  80.71 
 
 		 157 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  43.15 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  40.94 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 157 aa  88.6  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.62 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  34.03 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  36.28 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 175 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  37.17 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  37.17 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0245  AsnC family transcriptional regulator  73.33 
 
 		 45 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  31.43 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  37.4 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  37.96 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3196  transcriptional regulator, AsnC family  36.28 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  36.28 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  29.63 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  32.28 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  32.28 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>