More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4282 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4282  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
143 aa  296  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0184  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
143 aa  296  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0186  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
143 aa  296  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4150  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
143 aa  296  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  97.2 
 
 
143 aa  288  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  97.2 
 
 
143 aa  288  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  96.5 
 
 
158 aa  287  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4567  AsnC family transcriptional regulator  96.5 
 
 
143 aa  286  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  90.91 
 
 
143 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3459  AsnC family transcriptional regulator  88.73 
 
 
143 aa  268  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  87.32 
 
 
142 aa  261  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  84.62 
 
 
145 aa  251  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  80.71 
 
 
157 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  51.09 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  41.78 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
142 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  40.94 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  32.37 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  32.14 
 
 
150 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  34.03 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.51 
 
 
152 aa  77  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0245  AsnC family transcriptional regulator  75.56 
 
 
45 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 
146 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
154 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  32.77 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  37.96 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  35.65 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  34.17 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  33.58 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  35.96 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
165 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1435  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.855042  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.85 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  32.84 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  36.17 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  35.4 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>