More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2240 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  326  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  79.11 
 
 		 163 aa  260  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  43.57 
 
 		 167 aa  123  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  44.93 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5771  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 240 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647844  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  43.07 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 		 192 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.58 
 
 		 181 aa  98.2  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 167 aa  90.9  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 181 aa  87.8  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  34.46 
 
 		 164 aa  87.8  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 170 aa  87.4  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 		 153 aa  87.4  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  33.12 
 
 		 175 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  33.12 
 
 		 175 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  33.12 
 
 		 175 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  33.12 
 
 		 175 aa  87.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  33.12 
 
 		 229 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 202 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  35.46 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 202 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.64 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 197 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3448  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0711543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  32.9 
 
 		 229 aa  84.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  40.29 
 
 		 151 aa  84.3  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  31.72 
 
 		 158 aa  84.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  40.5 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 151 aa  84  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  29.66 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  29.66 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.01 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3752  hypothetical protein  39.83 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  29.66 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  29.66 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  29.66 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  30.07 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.29 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  28.97 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  30.07 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  30.07 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  30.07 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  33.33 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  32.48 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1518  leucine-responsive regulatory protein  33.33 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  30.07 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>