More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1159 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1159  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  308  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000552  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  30 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  31.82 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  29.71 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3362  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.672026  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2600  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal  0.0676602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2396  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.41 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0951  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2907  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  26.92 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3196  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0892  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  26.15 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  26.15 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  26.15 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0243  AsnC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  29.32 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  25.38 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0284  transcriptional regulator, AsnC family protein  25.71 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2602  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0876876  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  27.54 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  27.54 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 203 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  25.55 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  29.61 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  24.65 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2577  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  24.82 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3761  AsnC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3834  AsnC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>