More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7984 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
150 aa  298  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  72.67 
 
 
150 aa  219  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  71.14 
 
 
150 aa  216  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  70.47 
 
 
150 aa  214  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  67.79 
 
 
151 aa  202  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  64.38 
 
 
153 aa  197  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  60.4 
 
 
150 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  60.4 
 
 
150 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  62.07 
 
 
151 aa  185  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  60.4 
 
 
150 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  60.69 
 
 
151 aa  184  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  59.73 
 
 
150 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  53.02 
 
 
150 aa  154  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 
150 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
154 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 
167 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
153 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
181 aa  119  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  42.95 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3658  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
196 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  45.71 
 
 
152 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  41.61 
 
 
169 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 
159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  44.3 
 
 
157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  49.22 
 
 
134 aa  116  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
159 aa  115  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
153 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
156 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.27 
 
 
153 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
177 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  36.24 
 
 
156 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
152 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
154 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 
158 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
152 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
152 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
152 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
159 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
159 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  39.6 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3924  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  37.58 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  37.58 
 
 
162 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 
155 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
172 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
162 aa  111  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  41.22 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.58 
 
 
162 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
166 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  41.55 
 
 
152 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  41.55 
 
 
152 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  41.55 
 
 
152 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  36.91 
 
 
155 aa  110  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
153 aa  110  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  41.55 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  40.27 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0071  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2822  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.448359 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>