More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1670 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
157 aa  315  1e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  75 
 
 
156 aa  249  1e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2297  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
152 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
153 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1460  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
154 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
155 aa  91.7  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  28.38 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  31.29 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  33.07 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  28.67 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  28.67 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  28.67 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  28.67 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  27.45 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.07 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  27.56 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  31.94 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  32.31 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2868  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3060  transcriptional regulator, AsnC family  28.86 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  35.16 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1034  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>