More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3734 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 328 aa  84  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 		 296 aa  64.3  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  26.56 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  26.71 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  30.2 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  27.81 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  27.21 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  26.21 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  30.25 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  32.82 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 329 aa  57.4  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  25.17 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  27.33 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1159  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  49.09 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  27.48 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3604  AsnC family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0558735  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  23.7 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  25.53 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.15 
 
 		 302 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  23.49 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  32.69 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  24.03 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3068  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 299 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  26.09 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  34.38 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  25.32 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  25.37 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.95 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  24.18 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  24.18 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  33.08 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  24.18 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  27.15 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  26.24 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  28.79 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  25.17 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  23.13 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>