More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3735 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 173 aa  103  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 173 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  39.84 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  31.71 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.2 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 171 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.15 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  31.45 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  32.52 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  33.07 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1398  transcriptional regulator, AsnC family  31.45 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000730025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2564  transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000245522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  29.57 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  30.7 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  37.39 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1380  AsnC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.3 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1867  AsnC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  27.87 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0516  AsnC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.904906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2854  AsnC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.682629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  29.01 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  30.95 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  36.44 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  32.23 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0383  AsnC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.900371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  33.07 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3855  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196684  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1587  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3432  transcriptional regulator, AsnC family  26.98 
 
 		 342 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2096  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  29.03 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  33.68 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  27.64 
 
 		 153 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0296  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.97 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000616302  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2301  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  34.34 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.817585  normal  0.3392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>