48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3432 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3432  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
342 aa  692    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3775  AsnC family transcriptional regulator  67.55 
 
 
343 aa  461  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4591  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.31 
 
 
346 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0668779  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.13 
 
 
329 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  23.78 
 
 
320 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8204  putative transcriptional regulator, AsnC family  23.51 
 
 
331 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0030  transcriptional regulator, AsnC family  23.46 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.187033  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  26.98 
 
 
134 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  24.15 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  29.09 
 
 
170 aa  52.8  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  24.42 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  27.21 
 
 
148 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 
160 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 
160 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 
160 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 
160 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 
160 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 
160 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 
160 aa  49.7  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  25.08 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  24.82 
 
 
153 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  23.24 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  22.92 
 
 
159 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
156 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  22.97 
 
 
156 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  26.47 
 
 
160 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.27 
 
 
155 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  22.46 
 
 
149 aa  46.6  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
157 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2726  transcriptional regulator, AsnC family  25.77 
 
 
329 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.062066  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 
77 aa  46.2  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  23.48 
 
 
153 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  24.82 
 
 
157 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  25.83 
 
 
158 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4193  transcriptional regulator, AsnC family  22.7 
 
 
153 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.209273  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  28.7 
 
 
156 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  25.68 
 
 
155 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1225  AsnC family transcriptional regulator  23.36 
 
 
143 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  23.66 
 
 
169 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  24.6 
 
 
155 aa  43.1  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  28.76 
 
 
158 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  24.31 
 
 
157 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 
159 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  26.45 
 
 
168 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  23.91 
 
 
155 aa  42.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3532  AsnC family transcriptional regulator  27.85 
 
 
159 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  28.06 
 
 
145 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>