More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2732 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  321  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
162 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
164 aa  104  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
161 aa  102  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
162 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 
162 aa  101  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 
168 aa  98.6  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 
176 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 
176 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 
176 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
164 aa  97.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
171 aa  97.1  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.67 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 
184 aa  94.4  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 
163 aa  91.3  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  33.97 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  34.85 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3829  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4759  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
154 aa  87  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
172 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
328 aa  84  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5396  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1611  normal  0.0284366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1797  putative leucine-responsive regulatory protein  36.62 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  35.38 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1387  putative leucine-responsive regulatory protein  36.62 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0428  putative leucine-responsive regulatory protein  36.62 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
308 aa  81.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0951  putative leucine-responsive regulatory protein  36.43 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191831  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1881  putative leucine-responsive regulatory protein  36.43 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0345  Lrp regulator  36.43 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0217  putative leucine-responsive regulatory protein  36.43 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1100  leucine-responsive regulatory protein, putative  35.71 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121035  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3597  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.680866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  34.88 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0870  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592101  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  31.34 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2859  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5406  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4793  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4141  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3375  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
299 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3619  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.378157  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5156  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.949798  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  35.59 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05577  transcription regulator protein  33.57 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3309  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0359106 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  35.59 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5214  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
158 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5098  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  34.07 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  25.76 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0849  AsnC family transcriptional regulator  27.5 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0270  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  32.85 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 
291 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>