More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0684 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  69.18 
 
 		 165 aa  226  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  63.75 
 
 		 161 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  68 
 
 		 171 aa  211  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  63.58 
 
 		 164 aa  210  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  66.44 
 
 		 171 aa  202  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  66.03 
 
 		 162 aa  201  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  65.38 
 
 		 159 aa  200  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  62.82 
 
 		 173 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  66.44 
 
 		 164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 173 aa  194  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  59.01 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 162 aa  190  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  56.97 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 176 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 176 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 176 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  66.44 
 
 		 165 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  56.1 
 
 		 184 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 177 aa  130  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  40.38 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  38.26 
 
 		 308 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 360 aa  95.5  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 		 302 aa  93.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 299 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 157 aa  84  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  25.87 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 		 296 aa  70.9  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  32.35 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  32.28 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  31.36 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 		 137 aa  67  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.97 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  34.96 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  34.71 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  35.2 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1446  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.31 
 
 		 152 aa  62  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 		 338 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  33.08 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 		 329 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  34.15 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  27.97 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  35.43 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0418  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550786  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  30.88 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.572639 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  27.54 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.5 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>