More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4037 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 296 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.98 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  37.11 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  31.38 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 328 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 171 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 162 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.37 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  36.77 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 173 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 		 159 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0301  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 164 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 155 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  33.82 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  28.65 
 
 		 184 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3111  transcriptional regulator, AsnC family  28.11 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  34.65 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  26.76 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 162 aa  57  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  33.08 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  34.81 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  36.63 
 
 		 137 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  34.96 
 
 		 153 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 138 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  25.5 
 
 		 148 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 154 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  28.79 
 
 		 152 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 		 153 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 175 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  26.28 
 
 		 153 aa  53.1  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 		 152 aa  53.1  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 158 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 157 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  33.9 
 
 		 153 aa  52.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 144 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 142 aa  52.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 		 152 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 		 145 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 173 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 		 174 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  28.91 
 
 		 163 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 152 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 141 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  25.82 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 143 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 149 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  28.24 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3605  putative transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  31.71 
 
 		 158 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 140 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 		 145 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  25.87 
 
 		 166 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 140 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 167 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 143 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 		 148 aa  50.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  30.56 
 
 		 155 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 139 aa  50.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 147 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 154 aa  49.7  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  29.1 
 
 		 149 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 167 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>