More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2373 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 153 aa  304  3e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  77.63 
 
 		 152 aa  249  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1460  transcriptional regulator, AsnC family  77.78 
 
 		 154 aa  245  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  77.63 
 
 		 152 aa  243  8e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2297  transcriptional regulator, AsnC family  75.16 
 
 		 154 aa  238  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  76.32 
 
 		 153 aa  235  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  71.9 
 
 		 153 aa  229  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  52.74 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  30.14 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 174 aa  67  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  29.14 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  24.14 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1418  AsnC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  23.45 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  32.98 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  32.98 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  28.43 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  29.37 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1435  AsnC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.855042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  27.07 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  25.71 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  25.17 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  26.62 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  28.78 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  27.21 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3605  AsnC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.641359  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  30.37 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  32.04 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  25.17 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  30.88 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.36 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1202  AsnC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.718344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  26.87 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4644  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.94976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  32.38 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  29.92 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  23.78 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2846  transcriptional regulator, AsnC family  30.17 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00639698  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>