More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1418 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1418  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  303  4.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  65.97 
 
 		 148 aa  199  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.88 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  40.74 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2860  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.41994  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  42.55 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  27.33 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1209  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  36.61 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  36.79 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  34.17 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  36.13 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  28.87 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  38.04 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  28.28 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  27.89 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  26 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  27.08 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  35.4 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  27.4 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  29.23 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  28.17 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  31.67 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  28.17 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  27.34 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  26.21 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.51 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  28.17 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.29 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>