More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2404 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
165 aa  335  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  49.38 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  53.25 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  54.29 
 
 
159 aa  169  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 
162 aa  167  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  52.14 
 
 
159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  49.37 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  51.77 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  51.77 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  47.27 
 
 
178 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  50.33 
 
 
166 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  47.77 
 
 
159 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  46.84 
 
 
162 aa  154  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  45.78 
 
 
165 aa  152  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  45.78 
 
 
165 aa  152  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  45.18 
 
 
165 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  44.58 
 
 
165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  44.58 
 
 
165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  46.2 
 
 
164 aa  150  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  45 
 
 
162 aa  150  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  48.65 
 
 
160 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  43.98 
 
 
168 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  43.98 
 
 
168 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  43.98 
 
 
168 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  48.65 
 
 
160 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  43.98 
 
 
165 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  43.98 
 
 
168 aa  148  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  47.97 
 
 
160 aa  147  8e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  44.85 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  43.4 
 
 
163 aa  144  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  42.41 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  39.62 
 
 
163 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
159 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  43.67 
 
 
161 aa  136  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 
163 aa  134  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  37.11 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
161 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  38.99 
 
 
162 aa  121  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  33.75 
 
 
162 aa  121  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  32.48 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 
164 aa  115  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
161 aa  110  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
163 aa  100  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  29.58 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  30.07 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1418  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  32.06 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  25.74 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  28.67 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  27.54 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  27.14 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  26.06 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
155 aa  62.4  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  24.24 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  24.36 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  30.97 
 
 
166 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  26.12 
 
 
154 aa  61.6  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
172 aa  61.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 
158 aa  61.2  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  29.85 
 
 
172 aa  60.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  25.87 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  26.95 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  24.11 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  29.08 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  29.08 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  31 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  30.2 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  28.67 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>