More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1209 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1209  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  302  8.000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1202  AsnC family transcriptional regulator  69.74 
 
 		 152 aa  224  5.0000000000000005e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.718344  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2860  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.41994  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1418  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  29.53 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.53 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.86 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  28.35 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  33.81 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  27.4 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  27.4 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1795  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0732  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  27.59 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  26.21 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  27.15 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  26.9 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  25.69 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.33 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  29.53 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  29.05 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  30.69 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.03 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0383  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.900371 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0828  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3604  AsnC family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0558735  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.19 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  28.42 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 175 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0745  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.08 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0295235  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  25 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  25.32 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>