More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0745 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0745  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
159 aa  317  3.9999999999999996e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0295235  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2728  putative transcriptional regulator, AsnC family  62.91 
 
 
156 aa  194  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3161  putative transcriptional regulator, AsnC family  52.35 
 
 
250 aa  157  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2530  putative transcriptional regulator, AsnC family  51.66 
 
 
167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.25598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2283  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.26 
 
 
160 aa  147  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0564  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.72 
 
 
251 aa  143  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1795  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.16 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3000  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 
157 aa  136  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0928  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 
156 aa  135  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.508766  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1210  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.15 
 
 
255 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0299  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 
154 aa  131  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0717  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2355  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.62 
 
 
255 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0237223 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2848  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 
164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1748  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0810392 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0296  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000616302  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0700  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.04 
 
 
264 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.961191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0732  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.71 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 
173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1023  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.71 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.613371  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  38.26 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1086  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  34.62 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.11 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  33.65 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 
157 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.353401 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  30.95 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  32.23 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  32.8 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
195 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0789  AsnC family transcriptional regulator  34.11 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  34.26 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  32.2 
 
 
169 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
172 aa  58.2  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  32.23 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
203 aa  57.4  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 
172 aa  57.4  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3752  hypothetical protein  34.11 
 
 
170 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  33.06 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  31.71 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1209  AsnC family transcriptional regulator  32.08 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  30.95 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  31.71 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  29.32 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  36.26 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  28.7 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  36.26 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  32.54 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  34.71 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1435  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.855042  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  41.43 
 
 
170 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5396  transcriptional regulator, AsnC family  31.45 
 
 
175 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1611  normal  0.0284366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  33.04 
 
 
171 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  34.26 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  30.47 
 
 
158 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
149 aa  54.3  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
166 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 
151 aa  53.9  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  30.65 
 
 
157 aa  53.9  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 
162 aa  53.9  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  34.26 
 
 
157 aa  53.9  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
159 aa  53.9  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  30.95 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  33.68 
 
 
170 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  30.82 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  33.68 
 
 
170 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  34.82 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  31.4 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  26.98 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  26.27 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2595  transcriptional regulator, AsnC family  34.68 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  32.81 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  29.66 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  33.06 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1202  AsnC family transcriptional regulator  29.57 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.718344  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.95 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  40.58 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
145 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
170 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  29.92 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  29.37 
 
 
145 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>