More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3705 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  320  6e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  320  6e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3604  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 178 aa  97.1  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0558735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3734  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 328 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3614  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297843  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3706  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3333  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  32.37 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  31.51 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  37.86 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0833  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  28 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  26.67 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  29.46 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  21.85 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2355  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.68 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0237223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  29.55 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.06 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  29.03 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  25.87 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4221  AsnC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  25 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  23.68 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  27.27 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  23.68 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  23.68 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  23.68 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  27.34 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  26.21 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  26.21 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  24.83 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  23.03 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  34.65 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  23.03 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  23.03 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  23.03 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  23.03 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3605  AsnC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.641359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>