More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0700 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0700  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
264 aa  528  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.961191  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0564  putative transcriptional regulator, AsnC family  62.35 
 
 
251 aa  298  6e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3161  putative transcriptional regulator, AsnC family  59.11 
 
 
250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2355  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.79 
 
 
255 aa  235  6e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0237223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1210  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.83 
 
 
255 aa  226  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2728  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 
156 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0745  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.04 
 
 
159 aa  125  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0295235  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2848  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.1 
 
 
164 aa  115  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2283  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 
160 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3000  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 
157 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1795  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 
158 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0928  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 
156 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.508766  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2530  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 
167 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.25598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0299  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 
154 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0296  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.13 
 
 
161 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000616302  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0717  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
157 aa  95.5  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1748  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.12 
 
 
155 aa  95.1  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0810392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0732  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 
166 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4617  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 
173 aa  92  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  47.25 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  46.15 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  47.25 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
156 aa  60.1  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.9 
 
 
149 aa  59.3  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 
151 aa  58.9  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
157 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 
153 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1023  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.23 
 
 
134 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.613371  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 
180 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  34.17 
 
 
180 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  26.47 
 
 
153 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1209  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
152 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
171 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
157 aa  53.9  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1086  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
158 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  30.53 
 
 
162 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  32.73 
 
 
160 aa  52.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  31.75 
 
 
162 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  28.79 
 
 
156 aa  52.4  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
152 aa  52.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
168 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 
174 aa  52.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  31.5 
 
 
157 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  31.4 
 
 
166 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  29.27 
 
 
156 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
180 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  30.58 
 
 
162 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  30.58 
 
 
162 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  31.75 
 
 
169 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  28.18 
 
 
157 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  31.4 
 
 
162 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  31.4 
 
 
162 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  31.4 
 
 
162 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  31.4 
 
 
162 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.37 
 
 
181 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  41.54 
 
 
164 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  25.71 
 
 
165 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  26.19 
 
 
150 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
157 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
154 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  26.83 
 
 
162 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3598  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
151 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
156 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.45 
 
 
165 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  27.55 
 
 
151 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  29.6 
 
 
145 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  33.67 
 
 
152 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
162 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  29.6 
 
 
154 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
144 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 
150 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  32.32 
 
 
147 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
153 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  27.91 
 
 
145 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  31.07 
 
 
217 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  26.19 
 
 
150 aa  49.3  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  45.61 
 
 
166 aa  48.9  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
151 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  45.61 
 
 
166 aa  48.9  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 
158 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  28.7 
 
 
152 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  43.86 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  40.62 
 
 
153 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  33.06 
 
 
192 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  35.35 
 
 
152 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 
145 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  33.06 
 
 
154 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
152 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  33.6 
 
 
152 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3959  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
158 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  31.19 
 
 
162 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 
172 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  31.19 
 
 
162 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0316  AsnC family transcriptional regulator  30.95 
 
 
143 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 
152 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 
152 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  29.6 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  28.1 
 
 
155 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 
162 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>